Protein–RNA interactions for Protein: P01726

Ig lambda-1 chain V region H2020, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01726 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01726 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01726 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01726 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01726 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01726 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01726 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01726 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01726 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01726 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01726 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01726 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01726 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01726 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01726 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01726 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01726 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01726 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01726 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01726 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01726 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01726 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01726 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01726 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01726 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01726 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01726 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01726 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01726 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01726 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01726 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01726 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01726 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01726 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01726 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01726 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01726 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01726 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01726 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01726 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01726 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01726 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01726 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01726 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01726 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01726 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01726 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01726 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01726 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01726 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01726 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01726 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01726 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01726 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01726 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01726 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01726 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01726 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01726 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01726 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01726 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01726 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01726 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01726 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01726 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01726 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01726 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01726 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01726 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01726 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01726 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01726 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01726 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01726 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01726 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01726 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01726 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01726 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01726 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01726 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01726 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01726 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01726 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01726 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01726 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01726 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01726 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01726 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01726 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01726 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01726 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01726 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01726 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01726 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01726 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01726 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01726 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01726 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01726 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01726 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms