Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01659 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01659 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01659 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01659 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01659 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01659 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01659 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01659 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01659 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01659 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01659 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01659 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01659 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01659 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01659 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01659 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01659 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01659 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01659 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01659 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01659 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01659 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01659 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01659 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01659 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01659 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01659 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01659 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01659 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01659 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01659 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01659 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01659 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01659 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01659 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01659 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01659 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01659 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01659 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01659 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01659 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01659 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01659 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01659 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01659 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01659 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01659 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01659 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01659 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01659 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01659 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01659 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01659 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01659 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01659 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01659 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01659 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01659 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01659 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01659 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01659 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01659 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01659 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01659 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01659 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01659 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01659 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01659 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01659 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01659 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01659 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01659 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01659 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01659 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01659 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01659 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01659 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01659 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01659 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01659 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01659 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P01659 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01659 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01659 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01659 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01659 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01659 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01659 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
P01659 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01659 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01659 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01659 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01659 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01659 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01659 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
P01659 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01659 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01659 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01659 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms