Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abl1P00520 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abl1P00520 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abl1P00520 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abl1P00520 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abl1P00520 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abl1P00520 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abl1P00520 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abl1P00520 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abl1P00520 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abl1P00520 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Abl1P00520 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abl1P00520 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abl1P00520 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abl1P00520 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abl1P00520 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abl1P00520 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abl1P00520 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abl1P00520 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms