Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms