Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MscO88940 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MscO88940 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MscO88940 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MscO88940 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MscO88940 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MscO88940 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MscO88940 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MscO88940 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MscO88940 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MscO88940 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MscO88940 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MscO88940 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MscO88940 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MscO88940 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MscO88940 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MscO88940 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MscO88940 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MscO88940 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MscO88940 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MscO88940 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MscO88940 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MscO88940 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MscO88940 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MscO88940 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MscO88940 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MscO88940 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MscO88940 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MscO88940 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MscO88940 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MscO88940 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MscO88940 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MscO88940 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MscO88940 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MscO88940 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MscO88940 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MscO88940 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MscO88940 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MscO88940 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MscO88940 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MscO88940 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MscO88940 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MscO88940 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MscO88940 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MscO88940 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MscO88940 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MscO88940 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MscO88940 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MscO88940 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MscO88940 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MscO88940 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MscO88940 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MscO88940 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MscO88940 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MscO88940 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MscO88940 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MscO88940 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MscO88940 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MscO88940 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MscO88940 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MscO88940 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MscO88940 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MscO88940 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MscO88940 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MscO88940 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MscO88940 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MscO88940 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MscO88940 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MscO88940 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MscO88940 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MscO88940 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MscO88940 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MscO88940 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MscO88940 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MscO88940 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MscO88940 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MscO88940 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MscO88940 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MscO88940 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MscO88940 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MscO88940 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MscO88940 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MscO88940 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MscO88940 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MscO88940 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MscO88940 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MscO88940 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MscO88940 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MscO88940 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MscO88940 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MscO88940 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MscO88940 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MscO88940 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MscO88940 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MscO88940 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MscO88940 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MscO88940 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MscO88940 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MscO88940 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MscO88940 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms