Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Apaf1O88879 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apaf1O88879 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms