Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JtbO88824 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JtbO88824 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JtbO88824 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JtbO88824 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JtbO88824 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JtbO88824 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JtbO88824 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JtbO88824 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JtbO88824 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JtbO88824 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JtbO88824 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JtbO88824 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JtbO88824 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JtbO88824 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JtbO88824 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JtbO88824 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JtbO88824 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
JtbO88824 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JtbO88824 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JtbO88824 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
JtbO88824 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
JtbO88824 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
JtbO88824 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
JtbO88824 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
JtbO88824 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
JtbO88824 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
JtbO88824 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
JtbO88824 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
JtbO88824 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
JtbO88824 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
JtbO88824 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
JtbO88824 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
JtbO88824 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
JtbO88824 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
JtbO88824 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
JtbO88824 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
JtbO88824 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
JtbO88824 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
JtbO88824 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
JtbO88824 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
JtbO88824 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
JtbO88824 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
JtbO88824 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
JtbO88824 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
JtbO88824 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
JtbO88824 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
JtbO88824 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
JtbO88824 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
JtbO88824 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
JtbO88824 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
JtbO88824 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
JtbO88824 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JtbO88824 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JtbO88824 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JtbO88824 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JtbO88824 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JtbO88824 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JtbO88824 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JtbO88824 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JtbO88824 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JtbO88824 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JtbO88824 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JtbO88824 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JtbO88824 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JtbO88824 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JtbO88824 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JtbO88824 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
JtbO88824 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
JtbO88824 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
JtbO88824 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
JtbO88824 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
JtbO88824 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
JtbO88824 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
JtbO88824 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
JtbO88824 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
JtbO88824 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
JtbO88824 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
JtbO88824 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
JtbO88824 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
JtbO88824 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
JtbO88824 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
JtbO88824 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
JtbO88824 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
JtbO88824 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
JtbO88824 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
JtbO88824 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
JtbO88824 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
JtbO88824 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
JtbO88824 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
JtbO88824 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
JtbO88824 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
JtbO88824 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
JtbO88824 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
JtbO88824 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
JtbO88824 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
JtbO88824 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
JtbO88824 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
JtbO88824 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
JtbO88824 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms