Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
BlmO88700 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
BlmO88700 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
BlmO88700 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
BlmO88700 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
BlmO88700 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
BlmO88700 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
BlmO88700 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
BlmO88700 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
BlmO88700 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
BlmO88700 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC31.07■■■□□ 2.57
BlmO88700 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
BlmO88700 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
BlmO88700 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
BlmO88700 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
BlmO88700 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
BlmO88700 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
BlmO88700 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
BlmO88700 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
BlmO88700 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
BlmO88700 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
BlmO88700 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
BlmO88700 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BlmO88700 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BlmO88700 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BlmO88700 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
BlmO88700 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
BlmO88700 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BlmO88700 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BlmO88700 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BlmO88700 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BlmO88700 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BlmO88700 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
BlmO88700 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BlmO88700 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BlmO88700 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
BlmO88700 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
BlmO88700 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
BlmO88700 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
BlmO88700 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
BlmO88700 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
BlmO88700 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
BlmO88700 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
BlmO88700 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
BlmO88700 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
BlmO88700 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
BlmO88700 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
BlmO88700 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
BlmO88700 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
BlmO88700 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
BlmO88700 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
BlmO88700 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
BlmO88700 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
BlmO88700 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
BlmO88700 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
BlmO88700 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
BlmO88700 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
BlmO88700 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
BlmO88700 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
BlmO88700 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
BlmO88700 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
BlmO88700 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
BlmO88700 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
BlmO88700 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
BlmO88700 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
BlmO88700 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
BlmO88700 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
BlmO88700 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
BlmO88700 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
BlmO88700 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
BlmO88700 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
BlmO88700 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
BlmO88700 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
BlmO88700 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
BlmO88700 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
BlmO88700 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
BlmO88700 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
BlmO88700 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BlmO88700 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BlmO88700 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
BlmO88700 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BlmO88700 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BlmO88700 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BlmO88700 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
BlmO88700 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
BlmO88700 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
BlmO88700 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
BlmO88700 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
BlmO88700 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
BlmO88700 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
BlmO88700 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
BlmO88700 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
BlmO88700 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
BlmO88700 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BlmO88700 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BlmO88700 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
BlmO88700 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
BlmO88700 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BlmO88700 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
BlmO88700 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms