Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a20bO88575 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc6a20bO88575 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc6a20bO88575 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc6a20bO88575 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc6a20bO88575 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc6a20bO88575 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc6a20bO88575 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms