Protein–RNA interactions for Protein: O88561

Slc27a3, Long-chain fatty acid transport protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a3O88561 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc27a3O88561 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc27a3O88561 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms