Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cops3O88543 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cops3O88543 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cops3O88543 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cops3O88543 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cops3O88543 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cops3O88543 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cops3O88543 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cops3O88543 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cops3O88543 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cops3O88543 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115 ms