Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme6O88425 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme6O88425 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme6O88425 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme6O88425 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme6O88425 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms