Protein–RNA interactions for Protein: O88351

Ikbkb, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkbkbO88351 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IkbkbO88351 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms