Protein–RNA interactions for Protein: O88319

Ntsr1, Neurotensin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntsr1O88319 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ntsr1O88319 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntsr1O88319 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms