Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sorl1O88307 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms