Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clec11aO88200 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec11aO88200 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms