Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HcrtO55241 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HcrtO55241 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HcrtO55241 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HcrtO55241 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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HcrtO55241 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HcrtO55241 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HcrtO55241 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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HcrtO55241 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HcrtO55241 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HcrtO55241 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HcrtO55241 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms