Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OtogO55225 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtogO55225 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtogO55225 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtogO55225 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtogO55225 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtogO55225 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtogO55225 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtogO55225 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtogO55225 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtogO55225 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtogO55225 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtogO55225 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
OtogO55225 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
OtogO55225 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtogO55225 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
OtogO55225 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtogO55225 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtogO55225 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtogO55225 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtogO55225 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtogO55225 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtogO55225 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtogO55225 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtogO55225 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtogO55225 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtogO55225 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtogO55225 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtogO55225 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtogO55225 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtogO55225 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtogO55225 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtogO55225 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtogO55225 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtogO55225 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OtogO55225 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtogO55225 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OtogO55225 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtogO55225 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtogO55225 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OtogO55225 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtogO55225 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OtogO55225 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtogO55225 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OtogO55225 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtogO55225 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtogO55225 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtogO55225 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtogO55225 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtogO55225 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtogO55225 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtogO55225 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtogO55225 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtogO55225 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtogO55225 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtogO55225 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtogO55225 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtogO55225 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtogO55225 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtogO55225 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtogO55225 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtogO55225 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtogO55225 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtogO55225 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtogO55225 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtogO55225 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtogO55225 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtogO55225 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtogO55225 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OtogO55225 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtogO55225 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtogO55225 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtogO55225 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtogO55225 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtogO55225 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtogO55225 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtogO55225 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtogO55225 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtogO55225 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtogO55225 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtogO55225 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtogO55225 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtogO55225 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtogO55225 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtogO55225 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
OtogO55225 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtogO55225 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OtogO55225 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OtogO55225 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
OtogO55225 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OtogO55225 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OtogO55225 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OtogO55225 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OtogO55225 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OtogO55225 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OtogO55225 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OtogO55225 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OtogO55225 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OtogO55225 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OtogO55225 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms