Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Supt5hO55201 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms