Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx4O55187 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx4O55187 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx4O55187 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx4O55187 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx4O55187 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cbx4O55187 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cbx4O55187 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cbx4O55187 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cbx4O55187 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cbx4O55187 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cbx4O55187 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cbx4O55187 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx4O55187 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cbx4O55187 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cbx4O55187 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cbx4O55187 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cbx4O55187 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cbx4O55187 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx4O55187 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx4O55187 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx4O55187 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx4O55187 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx4O55187 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx4O55187 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx4O55187 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx4O55187 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx4O55187 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx4O55187 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx4O55187 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx4O55187 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx4O55187 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms