Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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