Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syngr2O55101 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms