Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn20O55082 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms