Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Copb2O55029 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Copb2O55029 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Copb2O55029 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copb2O55029 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Copb2O55029 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Copb2O55029 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copb2O55029 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copb2O55029 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Copb2O55029 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copb2O55029 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms