Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SlkO54988 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SlkO54988 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SlkO54988 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SlkO54988 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SlkO54988 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SlkO54988 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SlkO54988 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SlkO54988 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SlkO54988 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SlkO54988 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SlkO54988 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SlkO54988 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SlkO54988 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SlkO54988 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SlkO54988 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SlkO54988 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SlkO54988 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SlkO54988 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SlkO54988 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SlkO54988 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SlkO54988 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SlkO54988 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SlkO54988 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SlkO54988 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SlkO54988 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SlkO54988 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SlkO54988 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SlkO54988 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SlkO54988 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SlkO54988 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SlkO54988 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SlkO54988 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SlkO54988 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SlkO54988 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SlkO54988 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SlkO54988 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SlkO54988 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SlkO54988 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SlkO54988 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SlkO54988 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SlkO54988 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SlkO54988 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SlkO54988 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SlkO54988 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SlkO54988 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SlkO54988 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SlkO54988 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SlkO54988 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SlkO54988 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SlkO54988 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SlkO54988 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SlkO54988 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SlkO54988 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SlkO54988 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SlkO54988 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SlkO54988 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SlkO54988 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SlkO54988 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SlkO54988 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SlkO54988 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SlkO54988 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SlkO54988 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SlkO54988 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SlkO54988 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SlkO54988 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SlkO54988 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SlkO54988 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SlkO54988 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SlkO54988 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SlkO54988 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SlkO54988 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SlkO54988 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SlkO54988 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SlkO54988 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SlkO54988 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SlkO54988 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SlkO54988 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SlkO54988 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SlkO54988 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SlkO54988 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SlkO54988 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SlkO54988 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SlkO54988 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SlkO54988 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SlkO54988 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SlkO54988 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SlkO54988 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SlkO54988 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SlkO54988 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SlkO54988 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SlkO54988 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SlkO54988 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SlkO54988 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SlkO54988 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SlkO54988 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SlkO54988 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SlkO54988 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SlkO54988 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SlkO54988 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms