Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smarce1O54941 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms