Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brs3O54798 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brs3O54798 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brs3O54798 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brs3O54798 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brs3O54798 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brs3O54798 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms