Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cavin1O54724 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cavin1O54724 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cavin1O54724 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin1O54724 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin1O54724 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin1O54724 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin1O54724 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin1O54724 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin1O54724 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin1O54724 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin1O54724 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cavin1O54724 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cavin1O54724 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cavin1O54724 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms