Protein–RNA interactions for Protein: O54709

Klrk1, NKG2-D type II integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrk1O54709 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Klrk1O54709 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms