Protein–RNA interactions for Protein: O35954

Pitpnm1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm1O35954 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pitpnm1O35954 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pitpnm1O35954 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms