Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk5r2O35926 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5r2O35926 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.5 ms