Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SpibO35906 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SpibO35906 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SpibO35906 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SpibO35906 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SpibO35906 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SpibO35906 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SpibO35906 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SpibO35906 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SpibO35906 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SpibO35906 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SpibO35906 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SpibO35906 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SpibO35906 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SpibO35906 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SpibO35906 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SpibO35906 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SpibO35906 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SpibO35906 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SpibO35906 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SpibO35906 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SpibO35906 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SpibO35906 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SpibO35906 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SpibO35906 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SpibO35906 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SpibO35906 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SpibO35906 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SpibO35906 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SpibO35906 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SpibO35906 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SpibO35906 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SpibO35906 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SpibO35906 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SpibO35906 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SpibO35906 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SpibO35906 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SpibO35906 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SpibO35906 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SpibO35906 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SpibO35906 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SpibO35906 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SpibO35906 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SpibO35906 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SpibO35906 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SpibO35906 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SpibO35906 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SpibO35906 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SpibO35906 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SpibO35906 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SpibO35906 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SpibO35906 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SpibO35906 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SpibO35906 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SpibO35906 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpibO35906 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpibO35906 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpibO35906 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpibO35906 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpibO35906 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpibO35906 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpibO35906 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SpibO35906 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SpibO35906 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SpibO35906 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SpibO35906 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SpibO35906 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SpibO35906 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SpibO35906 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SpibO35906 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SpibO35906 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SpibO35906 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SpibO35906 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SpibO35906 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SpibO35906 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SpibO35906 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SpibO35906 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SpibO35906 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SpibO35906 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SpibO35906 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SpibO35906 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SpibO35906 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SpibO35906 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SpibO35906 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SpibO35906 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SpibO35906 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SpibO35906 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SpibO35906 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SpibO35906 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SpibO35906 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SpibO35906 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SpibO35906 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SpibO35906 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SpibO35906 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SpibO35906 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SpibO35906 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SpibO35906 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SpibO35906 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SpibO35906 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SpibO35906 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms