Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timm44O35857 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timm44O35857 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Timm44O35857 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Timm44O35857 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timm44O35857 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timm44O35857 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Timm44O35857 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Timm44O35857 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Timm44O35857 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms