Protein–RNA interactions for Protein: O35718

Socs3, Suppressor of cytokine signaling 3, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs3O35718 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Socs3O35718 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs3O35718 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Socs3O35718 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs3O35718 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs3O35718 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs3O35718 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs3O35718 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs3O35718 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms