Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Tnfrsf18O35714 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Tnfrsf18O35714 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfrsf18O35714 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms