Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfibp2O35711 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ppfibp2O35711 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms