Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Notch2O35516 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Notch2O35516 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Notch2O35516 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Notch2O35516 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Notch2O35516 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Notch2O35516 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Notch2O35516 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Notch2O35516 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Notch2O35516 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Notch2O35516 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Notch2O35516 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Notch2O35516 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms