Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc27a2O35488 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc27a2O35488 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc27a2O35488 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc27a2O35488 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc27a2O35488 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc27a2O35488 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms