Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccrl2O35457 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccrl2O35457 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms