Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc18a3O35304 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc18a3O35304 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms