Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f3O35261 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f3O35261 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2f3O35261 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2f3O35261 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2f3O35261 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
E2f3O35261 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms