Protein–RNA interactions for Protein: O35235

Tnfsf11, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf11O35235 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf11O35235 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms