Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpaO35216 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpaO35216 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpaO35216 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpaO35216 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpaO35216 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpaO35216 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpaO35216 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpaO35216 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpaO35216 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpaO35216 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpaO35216 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CenpaO35216 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpaO35216 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpaO35216 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpaO35216 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpaO35216 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpaO35216 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpaO35216 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpaO35216 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpaO35216 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CenpaO35216 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpaO35216 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpaO35216 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpaO35216 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpaO35216 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CenpaO35216 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpaO35216 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CenpaO35216 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms