Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Nedd9O35177 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nedd9O35177 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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Nedd9O35177 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Nedd9O35177 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Nedd9O35177 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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