Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrc23O35125 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms