Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sema4dO09126 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema4dO09126 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4dO09126 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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