Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ltbp2O08999 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ltbp2O08999 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ltbp2O08999 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ltbp2O08999 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ltbp2O08999 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ltbp2O08999 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms