Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dctn1O08788 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dctn1O08788 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms