Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tcof1O08784 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms