Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nfil3O08750 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nfil3O08750 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nfil3O08750 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms